MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 1

Total Repeats: 108525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021877	ACGGCG	2	12	12	23	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526459012
2	NC_021877	GTC	2	6	26	31	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526459012
3	NC_021877	GGGCG	2	10	38	47	0 %	0 %	80 %	20 %	526459012
4	NC_021877	CG	3	6	61	66	0 %	0 %	50 %	50 %	526459012
5	NC_021877	CGG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526459012
6	NC_021877	GCC	2	6	138	143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526459012
7	NC_021877	CGC	2	6	196	201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526459012
8	NC_021877	CGC	2	6	218	223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526459012
9	NC_021877	CGA	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526459012
10	NC_021877	GAATC	2	10	343	352	40 %	20 %	20 %	20 %	526459012
11	NC_021877	CG	3	6	414	419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021877	GC	5	10	446	455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021877	CGGCG	2	10	470	479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_021877	CGGC	2	8	535	542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021877	CG	3	6	543	548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021877	GC	3	6	559	564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021877	CGT	2	6	568	573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021877	CG	4	8	584	591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021877	GCC	2	6	606	611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021877	CG	3	6	612	617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021877	CGA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021877	CGC	2	6	677	682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021877	GCCG	2	8	686	693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021877	GCC	2	6	695	700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021877	GC	4	8	730	737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021877	CG	3	6	748	753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021877	CAG	2	6	755	760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021877	GGC	2	6	775	780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021877	GC	4	8	779	786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021877	GCC	2	6	796	801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021877	GCA	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021877	CGTG	2	8	841	848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021877	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021877	GCC	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021877	CAG	2	6	887	892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021877	GCA	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021877	TCG	2	6	946	951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021877	GCC	2	6	968	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021877	GCA	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021877	CAG	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021877	CG	3	6	1113	1118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021877	CG	4	8	1120	1127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021877	AGC	2	6	1140	1145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021877	GCC	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021877	GCA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021877	GC	3	6	1243	1248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021877	GCGTC	2	10	1372	1381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021877	AGC	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021877	GC	4	8	1434	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021877	CG	4	8	1448	1455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021877	CGG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021877	GGC	2	6	1486	1491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021877	CG	3	6	1524	1529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021877	GGCG	2	8	1565	1572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021877	CGGCG	2	10	1610	1619	0 %	0 %	60 %	40 %	526457160
56	NC_021877	GC	3	6	1624	1629	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
57	NC_021877	GGCC	2	8	1648	1655	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
58	NC_021877	CGT	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457160
59	NC_021877	GCC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457160
60	NC_021877	GC	3	6	1699	1704	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
61	NC_021877	CCG	2	6	1710	1715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457160
62	NC_021877	GC	3	6	1726	1731	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
63	NC_021877	GC	3	6	1751	1756	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
64	NC_021877	CG	3	6	1760	1765	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
65	NC_021877	CGC	2	6	1793	1798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457160
66	NC_021877	GTC	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526457160
67	NC_021877	CGTCG	2	10	1808	1817	0 %	20 %	40 %	40 %	526457160
68	NC_021877	CG	3	6	1819	1824	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
69	NC_021877	GCG	3	9	1822	1830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457160
70	NC_021877	GC	4	8	1840	1847	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
71	NC_021877	GCGCG	2	10	1850	1859	0 %	0 %	60 %	40 %	526457160
72	NC_021877	GC	3	6	1862	1867	0 %	0 %	50 %	50 %	526457160
73	NC_021877	AGC	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021877	CGA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021877	TCGA	2	8	1983	1990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021877	TGCG	2	8	2094	2101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021877	CGC	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021877	CGA	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021877	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021877	GTC	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458289
81	NC_021877	TCG	2	6	2286	2291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458289
82	NC_021877	TCC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526458289
83	NC_021877	ACG	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458289
84	NC_021877	GCC	2	6	2347	2352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
85	NC_021877	CG	4	8	2374	2381	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
86	NC_021877	GC	3	6	2382	2387	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
87	NC_021877	TCGC	2	8	2400	2407	0 %	25 %	25 %	50 %	526458289
88	NC_021877	ACG	2	6	2422	2427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458289
89	NC_021877	GCG	2	6	2442	2447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458289
90	NC_021877	GCC	3	9	2485	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
91	NC_021877	GC	3	6	2509	2514	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
92	NC_021877	GCC	2	6	2555	2560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
93	NC_021877	CGC	2	6	2563	2568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
94	NC_021877	CGC	2	6	2584	2589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
95	NC_021877	GCG	2	6	2607	2612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458289
96	NC_021877	GC	3	6	2645	2650	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
97	NC_021877	GCA	3	9	2671	2679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458289
98	NC_021877	GCC	2	6	2687	2692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
99	NC_021877	CG	3	6	2703	2708	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
100	NC_021877	CGG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458289
101	NC_021877	GCAGC	2	10	2722	2731	20 %	0 %	40 %	40 %	526458289
102	NC_021877	TTCG	2	8	2774	2781	0 %	50 %	25 %	25 %	526458289
103	NC_021877	ACGG	2	8	2855	2862	25 %	0 %	50 %	25 %	526458289
104	NC_021877	GCG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458289
105	NC_021877	GTC	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458289
106	NC_021877	GGCGC	2	10	3040	3049	0 %	0 %	60 %	40 %	526458289
107	NC_021877	CGC	3	9	3047	3055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
108	NC_021877	GCGCG	2	10	3070	3079	0 %	0 %	60 %	40 %	526458289
109	NC_021877	GCC	2	6	3092	3097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458289
110	NC_021877	GC	3	6	3109	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
111	NC_021877	GC	3	6	3117	3122	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
112	NC_021877	GCCG	2	8	3140	3147	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
113	NC_021877	TCG	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458289
114	NC_021877	GCG	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458289
115	NC_021877	CGT	2	6	3197	3202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458289
116	NC_021877	CG	3	6	3217	3222	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
117	NC_021877	CGCGAG	2	12	3242	3253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526458289
118	NC_021877	GCG	2	6	3311	3316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458289
119	NC_021877	CG	3	6	3347	3352	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
120	NC_021877	GC	3	6	3386	3391	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
121	NC_021877	GCA	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458289
122	NC_021877	AGC	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458289
123	NC_021877	CGA	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458289
124	NC_021877	CG	3	6	3489	3494	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
125	NC_021877	CGT	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458289
126	NC_021877	GC	3	6	3506	3511	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
127	NC_021877	CG	3	6	3563	3568	0 %	0 %	50 %	50 %	526458289
128	NC_021877	GCGG	2	8	3571	3578	0 %	0 %	75 %	25 %	526458289
129	NC_021877	CGT	2	6	3616	3621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021877	GC	4	8	3653	3660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021877	GC	3	6	3697	3702	0 %	0 %	50 %	50 %	526457737
132	NC_021877	GCG	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457737
133	NC_021877	GGC	2	6	3752	3757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457737
134	NC_021877	AGCG	2	8	3769	3776	25 %	0 %	50 %	25 %	526457737
135	NC_021877	GC	3	6	3789	3794	0 %	0 %	50 %	50 %	526457737
136	NC_021877	CGC	2	6	3808	3813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457737
137	NC_021877	GC	3	6	3815	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	526457737
138	NC_021877	CG	4	8	3841	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	526457737
139	NC_021877	GGTC	2	8	3862	3869	0 %	25 %	50 %	25 %	526457737
140	NC_021877	GC	3	6	3871	3876	0 %	0 %	50 %	50 %	526457737
141	NC_021877	CGATCG	2	12	3877	3888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526457737
142	NC_021877	CGG	3	9	4003	4011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457737
143	NC_021877	CGG	2	6	4021	4026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457737
144	NC_021877	CGC	2	6	4031	4036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526457737
145	NC_021877	CGCC	2	8	4093	4100	0 %	0 %	25 %	75 %	526457737
146	NC_021877	CG	3	6	4136	4141	0 %	0 %	50 %	50 %	526457737
147	NC_021877	GCG	4	12	4161	4172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457737
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150	NC_021877	GCGATC	2	12	4224	4235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526457737
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157	NC_021877	CGG	2	6	4363	4368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_021877	CGT	2	6	4582	4587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_021877	CGGC	2	8	4588	4595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_021877	GCG	2	6	4623	4628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_021877	CG	3	6	4764	4769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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263	NC_021877	GCCG	2	8	7317	7324	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
264	NC_021877	ATC	2	6	7372	7377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526456872
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266	NC_021877	GC	3	6	7400	7405	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
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269	NC_021877	CGA	2	6	7484	7489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526456872
270	NC_021877	GCCG	2	8	7533	7540	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
271	NC_021877	CAT	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526456872
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274	NC_021877	CGG	2	6	7661	7666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526456872
275	NC_021877	GC	3	6	7683	7688	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
276	NC_021877	CGG	2	6	7721	7726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526456872
277	NC_021877	ACG	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526456872
278	NC_021877	CG	3	6	7783	7788	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
279	NC_021877	GC	3	6	7790	7795	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
280	NC_021877	TCG	2	6	7813	7818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526456872
281	NC_021877	GCGAGC	2	12	7819	7830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526456872
282	NC_021877	CG	3	6	7839	7844	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
283	NC_021877	CGT	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526456872
284	NC_021877	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	526456872
285	NC_021877	CGC	2	6	7878	7883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526456872
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288	NC_021877	CGG	3	9	7925	7933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526456872
289	NC_021877	CGA	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526456872
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300	NC_021877	CGA	2	6	8506	8511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458978
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378	NC_021877	GCCGAA	6	36	10630	10665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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380	NC_021877	GAAGCT	3	18	10693	10710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
381	NC_021877	GCCCTA	2	12	10726	10737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
382	NC_021877	GTC	2	6	10750	10755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_021877	GCG	2	6	10804	10809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526457381
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388	NC_021877	CGGC	2	8	11074	11081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
389	NC_021877	GTC	2	6	11097	11102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_021877	CG	3	6	11116	11121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
391	NC_021877	TGCG	2	8	11132	11139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
392	NC_021877	GCC	2	6	11157	11162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
393	NC_021877	CG	3	6	11207	11212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
394	NC_021877	CGG	2	6	11235	11240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_021877	GCAAC	2	10	11255	11264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
396	NC_021877	GCC	2	6	11314	11319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
397	NC_021877	GCC	2	6	11321	11326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
398	NC_021877	GCC	2	6	11328	11333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_021877	GCC	2	6	11335	11340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
400	NC_021877	GCC	2	6	11342	11347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
401	NC_021877	GCC	2	6	11349	11354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
402	NC_021877	GCC	2	6	11356	11361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_021877	CGG	2	6	11494	11499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458857
404	NC_021877	GAG	2	6	11513	11518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526458857
405	NC_021877	GC	3	6	11578	11583	0 %	0 %	50 %	50 %	526458857
406	NC_021877	CGCC	2	8	11650	11657	0 %	0 %	25 %	75 %	526458857
407	NC_021877	GCA	3	9	11725	11733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458857
408	NC_021877	CG	3	6	11821	11826	0 %	0 %	50 %	50 %	526458857
409	NC_021877	CGC	2	6	11832	11837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458857
410	NC_021877	CG	4	8	11839	11846	0 %	0 %	50 %	50 %	526458857
411	NC_021877	GGACGC	2	12	11857	11868	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526458857
412	NC_021877	CCGCG	2	10	11869	11878	0 %	0 %	40 %	60 %	526458857
413	NC_021877	GAC	2	6	11913	11918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458857
414	NC_021877	GAC	2	6	11946	11951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526458857
415	NC_021877	GCT	2	6	11968	11973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458857
416	NC_021877	TGC	2	6	12001	12006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526458857
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418	NC_021877	T	6	6	12055	12060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_021877	CGG	2	6	12135	12140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458713
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443	NC_021877	CG	3	6	12912	12917	0 %	0 %	50 %	50 %	526458713
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453	NC_021877	GC	5	10	13189	13198	0 %	0 %	50 %	50 %	526458713
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497	NC_021877	CG	4	8	14071	14078	0 %	0 %	50 %	50 %	526458713
498	NC_021877	GCC	2	6	14114	14119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526458713
499	NC_021877	GCG	2	6	14143	14148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526458713
500	NC_021877	GC	3	6	14159	14164	0 %	0 %	50 %	50 %	526458713

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